シリーズ第12戦マレーシアGPの決勝は25日、セパンサーキットで行われ、ロリス・カピロッシ選手（ドゥカティ）が、前戦日本GPに引き続き、2戦連続のポールトゥウインを飾った。ポールポジションのカピロッシ選手は、オープニングラップからレースの主導権を握り、最高峰クラスで初の２連勝。同時にドゥカティとブリヂストンにも初の２連勝をもたらした。
　一方、７番グリッドからスタートしたバレンティーノ・ロッシ選手（ゴロワーズ・ヤマハ）は、2位でフィニッシュし、最高峰クラスで5年連続、通算７度目となるタイトルを獲得した。ポイントランク2位のマックス・ビアッジ選手（レプソル・ホンダ）の成績に関係なく、表彰台に登ればタイトルが決定する条件の中、カピロッシ選手を猛追。最後はカルロス・チェカ選手（ドゥカティ）のアタックを僅少0.07秒差で抑え、4戦を残して、ミック・ドゥーハンに並ぶ５連覇を達成した。
　3位のチェカ選手は、昨年5月のフランスGP以来となる今季初の表彰台を獲得。以下、ニッキー・ヘイデン、マルコ・メランドリ、マックス・ビアッジ、ケニー・ロバーツ、アレックス・バロス、ジョン・ホプキンス、コーリン・エドワーズがトップ10を果たした。日本GPで3位と見事な復活を果たした玉田誠選手（コニカミノルタ・ホンダ）は12位でフィニッシュ。
　今季最高位タイの4番グリッドから好スタートを切った中野真矢選手（カワサキ）は、３位走行中の２ラップ目にセテ・ジベルナウ選手（テレフォニカ・モビスター・ホンダ）と接触、２人共、転倒リタイヤとなった。
　次戦カタールGPは、10月1日、ドーハのロセイルサーキットにて行われます。